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客觀的確定出版物和引用的趨勢,大多數生產機構和國家,頂級期刊上,最常被引用的文章和作者的網絡文章,從初級保健數據庫使用和分析數據(CPRD,薄,QResearch) pseudonymised電子健康記錄(EHRs)在英國。
方法描述性統計和科學計量工具被用來分析斯高帕斯數據集的1891篇文章。開放軟件被用來從數據集中提取網絡(Table2Net)、可視化和分析coauthorship學者和國家的網絡(Gephi)和密度地圖(VOSviewer)主題同現和cocitation》雜誌上的研究表明。
結果研究成果整體以每年18.65%的速度增加。盡管醫學研究的主要領域,更專業的研究領域包括生物化學和藥理學。研究人員來自英國,美國和西班牙的機構發表了論文。的大多數期刊出版這種類型的研究和引用論文大部分來自英國和美國。作者不同的作者3和6之間。關鍵字分析表明,吸煙,糖尿病,心血管疾病和精神疾病,以及藥物可以治療這種病症,如非甾體類抗炎藥、胰島素和抗抑鬱藥物構成研究的主要話題。Coauthorship網絡分析表明,引起科學家、董事或這些數據庫的創始人,不同程度,集群在科學界的中心。
結論有一個相當大的增加的出版物在初級保健研究電子醫療紀錄。英國已經被放置在不斷擴大的全球科學界的中心,促進國際合作和結合國際經驗在醫學、生物化學和製藥研究。
- 科學計量學
- 初級護理
- 患者電子病曆
- 統計數據和研究方法
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本研究的優點和局限性
研究首次執行科學計量分析研究輸出初級護理患者電子病曆的數據庫。
我們從1995年到2015年發表分析文章為了研究曆史的廣度和增長這種類型的研究。
分析僅限於文章和結構化數據檢索的斯高帕斯數據庫。
一些最新的文章和相關的引用可能沒有出現在斯高帕斯當數據集提取。
介紹
大數據(分析)指的是聚合和審訊的高容量,高速度,高的各種數據集,以揭示新的、不明顯的、信息和模式。1這個領域推進,因為技術和科學的信息基礎設施的發展和數字化。2對於政府來說,開放數據集州舉行的公民被認為,通過計算和算法分析,顛覆性的和變革性的影響的知識。3在英國,大(打開)數據一直處於最前沿的研究活動和決策。稱為八大技術之一,4英國有了大(打開)數據移動超過許多其他發達國家(如美國、澳大利亞、法國)。3大數據分析非常重要的一個領域是醫療保健。
在英國國民醫療服務製度(NHS)是圍繞初級保健,除非有意外事故或緊急情況,隻要公民想使用NHS,他們必須通過他們的初級護理醫師,在英國被稱為全科醫生(GP)。從那裏,他們可以被稱為專家醫院如果必要的話。全球定位係統(GPs)二級護理臨床醫生可以反饋信息。因為絕大多數的人口(98%)注冊全科,GPs行動不僅是英國國民健康保險製度的主要把關也是重要的托管人縱向電子健康記錄(EHR)。5現在有正在進行的初級護理病人匿名的數據庫記錄在英國,可用於醫療研究。這些以人群為基礎的數據庫包含數據來自日常慣例。一些新成立的數據庫和研究平台的電子醫療紀錄包括ResearchOne有關6和口徑。7雖然在英國有超過9600的一般行為,可能這些數據庫提供數據,8它通常是6 - 10%的這些做法,這樣做。
這樣的數據庫通常是用於橫斷麵調查、病例對照和隊列研究和流行病學、藥物安全、臨床和醫療研究目的使用。它們嚴重依賴於個體一般實踐自願貢獻數據通過適當的臨床係統使用維護這些病人記錄。記錄通常是匿名或pseudoanonymised源頭被分配一個惟一的編號,每個病人允許更新的記錄以及他們的鏈接到其他數據集,比如國家死亡率,國家癌症登記和醫院的記錄以及與社會經濟、種族和環境數據集。訪問這些數據集通常是獲得科學和倫理審查後,可以根據客戶的需求。在這項研究中,我們調查了三個這樣的研究成果數據庫,建立在研究社區和貢獻了大量的科學研究和出版物。這些是臨床實踐的研究數據鏈接(CPRD),9健康改善網絡(薄)10和QResearch。11
CPRD(原名慣例研究數據庫)是一個非盈利研究服務由NHS國家衛生研究所(NIHR)與藥物和保健產品監管署(MHRA)。是由英國衛生部和包含1100萬名患者(440萬)的記錄從674年通用做法。5有一個服務成本與被請求的數據的準備。與下麵描述的其他服務不同的是,CPRD不提取數據從一個特定的規範臨床係統。後任何慣例可以提供數據與軟件供應商數據共享協議。重要的是,它是唯一的網上數據庫訪問。12薄的數據庫包含1200萬名病人的醫療記錄約600一般臨床實踐,使用視覺係統在實踐中係統(輸入)。IMS Health能提供對數據的訪問,例如,每年通過有償學術機構。薄是唯一的數據庫,為營利性公司可以提供對數據的訪問。QResearch是一個位於諾丁漢大學的研究服務。其數據庫包含1800萬名病人的醫療記錄從1000年通用實踐臨床教育管理信息係統使用係統。隻有學者受雇於英國大學(網站)訪問隻有一個樣本的數據集(最高100 000名患者),就足以回答一個特定的研究問題或假說。本研究服務是非營利和完全自籌資金,通常有一個費用支付的費用數據提取。
這些數據庫的優勢在於他們的尺寸、寬度、代表性的英國人,長期跟蹤和數據質量。5包括良好的發病率和生活方式的信息,處方,預防保健,保健和interpractice變異的現行標準。13因為他們不斷(自動)更新,他們是理想的研究人員發現和監控醫療趨勢以及新幹預措施的有效性和治療,以最低的成本。他們越來越與二級護理和死亡率數據集。相比之下,他們的弱點包括這一事實數據提取適當的臨床係統為病人管理和開發不是用於醫療研究。有缺失數據的問題(例如,從健康的病人),變量定義為診斷和不完整的二級護理數據(如住院)。更廣泛的健康數據(如治療依從性,在櫃台藥物)和亞種群的數據(如囚犯,無家可歸者、難民、旅行者)不充分了。5信息治理和知情同意過程的數據共享電子病曆的研究仍然被認為是複雜的。14這些數據庫還需要大量的臨床和科學技術,以及數據管理技術能力支持研究。當選擇一個特定的數據資源進行觀察研究,研究人員必須考慮一些其他因素,如人口覆蓋及其地理分布,數據捕獲和延遲,連杆與其他資源,隱私和安全、質量和驗證。15
盡管如此,這些數據庫中高度重視研究團體,因為他們已經證明了自己的價值,幫助研究人員達成明確的答案在各種醫療保健辯論的公共利益,特別是在其他類型的研究產生了矛盾的證據。例如,2004年英國和加拿大的研究人員毫無疑問證明風疹(MMR)疫苗接種兒童自閉症沒有聯係。16相比昂貴、費時和代表性(人口)傳統的隨機試驗,17大規模、隨機觀測(比較)評價治療和藥物的最低限度為臨床醫生和患者突出的和務實的證據可以支持更快的周轉時間有用的在臨床實踐中。18
本研究的目的是進行科學計量分析的文章,從1995年到2015年出版,使用數據從至少一個初級保健數據庫。半自動的,這種經驗的方法定量分析大量的出版物提供了一個可靠和客觀的研究現狀和趨勢以及科學領域的結構和動力學。19,20.這樣,決策者、研究經費的身體但最重要的是新人員進入這個領域可以有一個總體概述它的知識庫和表明什麼樣的網絡特性,研究活動和主題感興趣的推動。20.,21我們所知,這是第一個研究初級保健係統映射的數據庫研究成果。
方法
在這項研究中,愛思唯爾的斯高帕斯數據庫(http://www.scopus.com)被選為結構化數據的來源的文章。該數據庫涵蓋了科學論文比其他數據庫(例如,湯森路透的網絡科學),提供的優勢促進出口結構化數據的功能,包括完整的引用信息,摘要,關鍵詞和引用。2015年10月30日,我們搜查,使用文檔搜索功能,為所有文章包含術語“慣例研究數據庫(大)”或“臨床實踐研究數據鏈(CPRD)”或“衛生改善網絡(薄)”或“QResearch”文章標題、摘要和關鍵詞。
結果是那麼有限文章,文章在新聞,會議論文,評論,書的章節和簡短的調查。筆記,信,社論和勘誤表被排除在分析之外。從那裏,我們比較了記錄的書目列表由這些數據庫維護22 - 24以包括文章,不能使用上麵的搜索查詢檢索。數據清理包括刪除重複的記錄和記錄丟失重要信息分析(例如,文章標題、期刊)。等領域的作者,一年,源標題,從屬關係,作者關鍵字和文檔類型被用於分析。
最後從斯高帕斯是進口書目檢索表2淨25提取的網絡作者,貢獻國家。當時進口Gephi26ForceAtlas 2算法在哪裏27用於可視化結構親近作者和社區的貢獻國家。VOSviewer (V.1.6.3)28軟件被用來想象文獻網絡和密度29日頻繁的術語和期刊。所有其他使用Microsoft Excel進行了統計分析。我們使用期刊引證報告(JCR)科學版2014提取識別期刊影響因子值。
結果
從1995年到2015年共1891篇論文被包含在這個文獻計量學和科學計量分析。結果列在下麵。
出版物和引用的趨勢
相關文獻3初級保健數據庫在英國從1995年的7篇論文逐漸增加到171年的2015人(表1)。我們估計他們的複合年增長率(CAGR) 1995年- 2014年的18.65%。絕大多數的論文發表在英語在425個不同來源(1995 - 2014年的複合年增長率16.76%)。總的來說,這些文件已經被引用了73 929次。然而,一小部分的1.16% (n = 163)論文尚未提到。平均每年引文3.52∼。
我們通過文檔類型出版物的分布進行了探討。這是在表2確定偏好的學者在研究中使用這些數據庫共享知識。絕大多數學者傾向於通過期刊上發表他們的研究的成果,特別是在原作(96.5%)。
接下來,我們分析了論文的分布基礎上的學科已經被斯高帕斯(分類表3),每篇論文的可能歸因於多個主題領域。30.因為我們分析了書目數據使用初級保健數據庫基於發表的研究,這一點也不奇怪,在絕大多數的論文醫學類別。然而,相當數量的論文(∼25%)下的類別生物化學、遺傳學和分子生物學和藥理學,毒理學和製藥學,這表明強調這些數據庫的使用研究藥物。它也表明這些數據庫的潛在利益的製藥行業。
最有效的機構和國家
深入洞察貢獻模式和科學的影響,我們首先確定了十大機構(通過的論文數量)作者作為背景,然後分析了引用模式(表4)。我們也分析了作者的從屬關係基礎上的國家機構。為此,每個被分配到出版其作者各自的附屬國家識別跨國合作的網絡。的分布提出了十大貢獻的國家表5。最後,我們使用Gephi形象化貢獻國家的網絡。我們結束了一個29節點和網絡175邊(圖1)。每個節點代表一個國家,而它的大小表示國家的學位論文的數量和顏色。互連線的厚度(邊緣)表示兩國合著論文的數量。
造成國家的網絡。
大多數的大學最有效的機構。頂尖大學包括諾丁漢大學,波士頓大學,倫敦大學學院(UCL),倫敦衛生與熱帶醫學學院和烏得勒支大學的。除了這些學術機構、研究單位在西班牙(CEIFE)和英國MHRA參與初級保健databases-based研究。在這個表中,我們也報告中位數差。從這個,似乎從CEIFE學者,賓夕法尼亞大學和波士頓大學的合作者高度引用的出版物相比其他機構在這個列表中。瑞士、加拿大、瑞典、德國、法國和意大利沒有機構前十名的名單,盡管他們排名前十名的富有成效的國家。英國學者發表的論文大部分(63.56%),其次是美國和西班牙。除了美國和加拿大,大部分的生產在歐洲國家。這兩個表中特別有趣的是,學者們在機構美國和西班牙的產生不僅大量的出版物也得到廣泛認可的出版物科學界的引用。
考慮到測量加權程度,聚類,特征向量中心和中間性中心(表6),我們觀察到再一次英國,其次是美國,被放置在這個科學社區的中心。度最高的所有測量,從這個國家機構最具權威和人脈廣泛的國家,促進其他國家的機構之間的連接。
頂級期刊上
在表7,我們確定十大期刊大多數研究發表的地方。6這些期刊出版的英國出版商和其他發表在美國。《華爾街日報》藥物和藥物安全功能列表的頂部,其次是英國臨床藥理學雜誌》上和藥物治療表明研究的重點,從這些初級保健數據庫、安全使用的藥物。這種關注也可以看到表3,(除了醫學)領域的論文發表生物化學、遺傳學和分子生物學和藥理學,毒理學和製藥學(斯高帕斯分類),但也在表5,大部分的top-cited論文引用特定的並發症的潛在風險/從特定藥物的使用條件。更專業的期刊,如糖尿病護理和風濕性疾病上,也出現在這個列表,表明一個特定的活動在特定光譜的疾病的研究的焦點。
此列表中的四個期刊開放獲取(BMJ,英國雜誌的慣例,《公共科學圖書館•綜合》,beplay体育官方手机版),這極大地促進了知識共享沒有限製。的BMJ享有廣泛認可的高質量的研究,發表的高影響因子。其餘的付費牆後麵,但作者提供一個開放的選擇發表他們的研究(混合訪問)。一個額外的列的這些十大期刊的影響因子表中2014年的JCR也補充說。
什麼也是特別重要的科學影響的十大最引用論文確定(看到了嗎表8)沒有被發表在期刊列表。然而,通過執行(計數)分析cocitation VOSviewer鏈接(圖2)在斯高帕斯期刊引用數據集(最小數量的引用= 10)我們看到大多數這個列表表示(blue-lowest密度,red-highest密度)。
cocitation分析》雜誌上。
最常被引用的論文
接下來,我們專注於十大報紙31-40並計算每篇論文引用的總數(表81995 - 2015年期間)。引用總計7194(1.02%)的所有引用數據集。看來,這些研究在癡呆、牛皮癬、骨折、心血管疾病和胃腸道並發症與某些藥物一直是科學界的極大的興趣。大多數的十大最常被引用的論文(60%)是開放獲取的出版商的網站,任何人都可以免費閱讀的。
10篇論文,8是單一國家文件,而沒有被授權。再次,美國有一個相當大的出現在這個列表,生產高度引用的論文。此外,許多高產的作者確認(表10在這個列表)也被發現。
作者模式和網絡
作者分布變化從單一到最多155年作者對一項研究關於國際合作的可行性評估,基於一個共同的協議,pH1N1疫苗接種後格林-巴利綜合征的風險。41總共有9385名作者參與了在1995 - 2015年1981篇論文。在表9,我們可以看到,四分之三以上的論文是由三個或三個以上作者發表的。隻有1%的論文是一個作者寫的,而五個文件沒有任何作者的細節。幾乎四分之一的由四位作者論文發表,已被廣泛引用整個科學界。這表明高度的專家在這一領域的合作,這是必要的在分析數以百萬計的初級護理記錄。
表10提供了排名前十的學者,首先,研究生產力的基於合著論文的總數。,一般來說,大多數學者都來自英國,西班牙Pharmacoepidemiologic研究中心的主任(CEIFE)42最多的學者發表的研究從這些初級保健數據庫。也有研究人員在這個領域並不一定來自於學術環境。製藥行業積極參與知識生產電子初級護理記錄。
隻考慮那些至少有兩篇論文合著的學者在這個數據集,分析提出了一個網絡(圖3),1261個節點和6186個邊緣。在這裏,每個節點代表一個作家,而它的大小表示作者的論文的數量。互連線(邊)表示之間的合著論文的作者。更好的可視化,我們有限的數量最低度5(最大度= 145)。模塊化後測量,確定群落結構,43我們看到一些建立合作團隊(集群不同顏色)在特定和高產的學者從初級保健數據庫數據的分析還發現表10。我們還觀察到一個新的(藍色)集群的首席統計學家薄44——三個初級保健數據庫進行了研究。
集群合著網絡。
考慮到測量加權程度,聚類,特征向量中心和中間性中心(表10),結果表明集群放置在這個科學社區的中心。最低程度的集群和最高學位的所有其他測量,其是最神通廣大的傑出學者,促進,比任何其他學者,其他科學之間的連接集群和學者。
是什麼還特別有趣的是,一些學者(和他們的機構)在這個列表是附屬,在某種程度上,這些數據庫,目前服務或作為他們的創始人,董事、首席科學家或他們的科學委員會的成員。45,46例如,波士頓協作藥物監測項目首席科學家在波士頓大學是最早開發的技術和科學能力pharmacoepidemiological這些數據庫的研究。47,48
研究主題
我們進行了一次關鍵字分析確定發表研究的重要主題。為此,我們首先從文獻中提取數據集由斯高帕斯5813獨特的關鍵字索引30.基於我們的分析更完整的索引信息相比,作者的關鍵詞。我們的前30名的關鍵字檢索兩個特定類別:醫療條件和藥物/物質(表11和12)。接下來,我們創建了一個(計算的)詞同現VOSviewer密度圖(圖4)通過構建一個文本語料庫中的標題和摘要字段的書目數據集(最小數量的一個術語出現= 10)。通過這種方式,我們能夠確定主題,不僅更頻繁地出現在文學,但這也密切相關,形成集群的話題。藍色代表低密度的條款和紅代表的最高密度條件。在許多情況下,密度地圖代表索引關鍵字的頻率表11和12。顯然,吸煙,糖尿病,心血管疾病、精神疾病、牛皮癬、肥胖、懷孕和癌症以及藥物和物質可以治療這些疾病,如阿司匹林、胰島素,抗抑鬱藥和非甾體類抗炎藥(非甾體抗炎藥),一直感興趣的學者在初級保健中使用電子醫療紀錄。
詞同現密度地圖。
討論
本研究確定了領導機構、國家、作者、期刊和主題以及他們的網絡出版研究使用初級保健數據庫在英國從電子醫療紀錄中提取和分析數據。越來越多的生產這樣的論文,表明全球科學界和高度協作的利益在這一領域的知識和見解,也可以獲得衛生保健的改善。產量從1995年的7篇論文增加171年出版2015年10月1995 - 2014年的複合年增長率(18.65%)。值得一提的是通過執行一個類似的,局限於英國,同期在斯高帕斯搜索和關鍵字“初級保健”我們發現的複合年增長率是10.83%,這顯示了這些數據庫的研究增加超過了更廣泛的領域。絕大多數的出版物(96.5%)期刊文章。雖然這個研究領域可以,一般來說,在醫學、生物化學和製藥的發展似乎是同樣重要的是,為了解決廣泛的醫療條件,如糖尿病、心血管疾病、精神疾病、吸煙、肥胖和癌症。
英國已經被放置在這個科學領域。這在一定程度上是由於這一事實現在有超過30年的數據可以在醫生信息係統。49投資發展中初級保健數據庫為研究目的電子醫療紀錄已經把國家的中心一個全球合作網絡,結合國際經驗分析不斷擴大和聯係日益緊密的臨床數據集從初級,二級和三級護理。訪問這些數據集也允許來自其他國家的研究人員和機構發展自己的項目的研究來回答重要的臨床問題。六個最高效的機構都位於英國,和63.56%的出版物是由學者隸屬於這個國家,緊隨其後的是美國。有趣的是,大學沒有專門的機構。其中,我們可以找到一個研究單位在西班牙(CEIFE)和行政機構在英國,基金和運行CPRD數據庫(MHRA),而最多產的學者之一,隸屬於一家製藥公司。這意味著不同演員的極大的興趣,從學術、政府和私營部門,與初級保健研究數據庫。
地理位置的趨勢也可以觀察到的期刊發表論文最多的。六個期刊發表在英國,緊隨其後的是美國。最多的期刊上發表論文藥物和藥物安全,BMJ,英國雜誌的慣例和英國臨床藥理學雜誌》上的極大的興趣,這意味著為製藥研究學者在使用電子醫療紀錄的數據。這部分原因是一個最古老的常規性的收集的信息在英國全科醫生和由這些數據庫提供藥物的曆史。47關於限製訪問研究成果,隻有四個完全開放獲取期刊在這個列表。這可能會限製訪問知識研究人員和公眾不能訂閱費用。有趣的是,這是更成熟的醫學期刊,等《美國醫學會雜誌》,《柳葉刀》和NEJM,發表了一些最常被引用論文的文獻數據集和享受高水平的cocitation活動。
關鍵字分析表明,吸煙,糖尿病,心血管疾病、精神疾病、牛皮癬、肥胖、懷孕和癌症構成研究活動的主題在初級保健中使用電子醫療紀錄。通常,本研究集中於發展中算法來確定發生的特定疾病的風險。感興趣的研究人員也研究藥物可以治療這些疾病,如阿司匹林、其他非甾體抗炎藥、胰島素和抗抑鬱藥。
對於絕大多數的出版物,作者作者3和6之間變化,表明廣泛合作,國際,努力促進在這個領域的研究。Coauthorship網絡分析表明,首席科學家、導演和這些數據庫的創始人發現,不同程度,集群的核心在科學界,強調知識生產的寶貴的貢獻。作為·阿祖萊等50已經證明在他們的研究領域的傑出的研究人員和活力,coauthorship網絡的發展和集群的合作者在新成立的科學領域可能有助於提高研究效率。每個數據庫的數據訪問需求的基礎上,他們建立了研究人員似乎根本作用和促進國際合作研究人員、機構和國家。重要的是,他們有一個清晰的、深入的理解的研究活動這些數據庫可以支持的數據質量,結構和電子健康檔案的編碼實踐。隨著這些數據庫預計在未來開放更多的利益相關者從不同學科在衛生和大學準備將訓練數據科學技能(如統計、生物信息學、生物學和醫學)51到他們的臨床課程,培養下一代的臨床調查,52這些研究人員可以促進建立質量、可靠和倫理上適當的科學研究53從複雜和高度上下文數據集。
我們的研究典型的科學計量研究的局限性。我們分析文章發表在一段20年為了探索曆史廣度和初級護理電子病曆的研究。然而,這種分析是有限的結構化數據從一個文獻數據庫檢索的同行評議的文獻。因此,文章發表在期刊的指數進行分析。此外,一些最新的文章和相關的引用可能沒有被檢索的搜索,這或許可以解釋出版物和引用的數量的減少特別是從2010年開始。這是超出了這個範圍定量研究評估的科學質量和社會經濟影響分析大量的出版物。這些研究部署一係列研究設計在許多領域的初級保健研究和各種研究成果。我們的主要目標是限製評估學術影響和研究質量的一個方麵,也就是說,在研究輸出模式和趨勢。54未來的研究可以關注更廣泛的學術和社會經濟影響的這些研究通過檢查出版物之間的關係,引用模式和協作的發展新的科學方法在該領域或新的醫療產品和醫療服務。
總之,輸出的初級護理電子病曆的研究一直以來增加了他們的發展。這些數據庫的發展在英國已經把國家和相關學術機構在不斷擴大的全球科學界的中心,促進國際合作和結合國際經驗在醫學、生物化學和製藥研究。
引用
腳注
貢獻者PV和聖的構思和設計研究。太陽能收集和分析數據。PV和聖解釋研究結果,起草提交的手稿和批準最終的手稿。
資金支持光伏瑪麗Skłodowska-Curie個人獎學金從歐洲委員會(2014 -如果- 659478)。聖部分支持的國家衛生研究所(NIHR)領導的合作應用衛生研究和護理(東部)。
免責聲明作者的觀點是,不一定的EC, NHS, NIHR或衛生部。
相互競爭的利益沒有宣布。
出處和同行評議不是委托;外部同行評議。
數據共享聲明沒有額外的數據是可用的。